L’observatoire bénéficie d’une organisation en réseau.

Il est notamment constitué :

d’un conseil de 25 membres, présidé par le ministre chargé de l’aménagement du territoire ou le délégué interministériel à l’aménagement et à la compétitivité des territoires ; il réunit des représentants des administrations, du Parlement, des collectivités territoriales, du Conseil national de l’aménagement du territoire, de la fédération nationale des agences d’urbanisme, et de cinq personnalités qualifiées ;

d’un réseau de partenaires, organismes impliqués dans la production ou l’utilisation d’informations territoriales à différents niveaux géographiques, du local à l’international ;